有两个孩子会根据子女利益和双方具体情况进行抚养权的判决。如果孩子还处于哺乳期有较大的可能性会将抚养权判给母亲，如果孩子过了哺乳期则根据谁的综合条件更有利于孩子健康成长判决。
【法律依据】
《民法典》第一千零八十四条：父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
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